HR人力资源管理系统的使用带来了一系列便利，但也不乏一些使用上的困扰。

首先，一些企业在引入HR系统时存在着一定的抵触情绪。这可能是由于员工对新系统的不熟悉，难以适应新的工作流程，导致短期内工作效率的下降。

其次，一些HR系统的界面设计过于复杂，不够直观，对于一些不熟悉电脑操作的员工来说，可能会觉得使用起来较为困难。

此外，一些HR系统在应对复杂的人力资源管理需求时可能存在功能不够强大的问题，导致在一些特殊情况下无法满足企业的实际需求。

最后，一些企业在引入HR系统时可能忽视了对员工的培训和指导，导致员工不能充分发挥系统的优势。

总之，虽然HR人力资源管理系统在提升管理效率和优化人力资源管理方面具有巨大潜力，但在实际应用中仍然需要企业和员工的积极配合和适应，才能发挥出其最大的优势。